User Tools

Site Tools


cogstate

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Next revision Both sides next revision
cogstate [2023/02/07 10:24]
flip Cogstate overal met 1 hoofdletter
cogstate [2023/03/03 14:01]
flip [Versions]
Line 39: Line 39:
  
 ===== Versions ===== ===== Versions =====
-The Cogstate was measured during [[2A Visit 1]] and [[3A Visit 1]]. During the third assessment ([[3A]]) the test was redesigned by the Cogstate research group. The test and protocol stayed the same for the participants,​ however more variables were measured during the test. For this reason the variables below are split between the [[2A]] ​and [[3A]] ​assessments.+The Cogstate ​brief battery ​was measured during [[2A Visit 1]] and [[3A Visit 1]]. During the third assessment ([[3A]]) the test was redesigned by the Cogstate research group. The test and protocol stayed the same for the participants,​ however more variables were measured during the test.\\ 
 +In [[2A Visit 1]] around 92.000 participants had valid Cogstate results. In [[3A Visit 1]] around 15.000 participants had valid results on the original brief battery and 24.000 on the redesigned version. At this moment assessment 3A is still going on, meaning the redesigned version number will increase overtime 
  
 === Variable suffixes === === Variable suffixes ===
-  * To reflect the difference between the variables ​of [[2A]] ​and [[3A]] ​please pay attention to how the variables are written in the columns ​named '​Code'​. +  * To reflect the difference between the Cogstate ​variables and the redesigned Cogstate variables, ​please pay attention to how the variables are written in the column ​named '​Code' ​in the variable table
-  * Most variables listed in the below tables ​are test specific. For this reason a '​_XX'​ will be added to the variable name in data releases. Due to a database variable continuity the '​_XX'​ suffixes per test are as followed:+  * Most variables listed in the below table are test specific. For this reason a '​_XX'​ will be added to the variable name in data releases. Due to a database variable continuity the '​_XX'​ suffixes per test are different from the order in which the tasks were performed. The suffixes ​are as followed:
  
  
-| **Task** ​ | **Suffix** ​ |+| **Task ​in order of completion**| **Suffix** ​ |
 | Detection task  | _01  | | Detection task  | _01  |
 | Identification task  | _02  | | Identification task  | _02  |
Line 55: Line 56:
  
 \\ \\
-===== Variables ​2A =====+===== Variables =====
  
 | **Label English** ​                                                                                                                                                              | **Code** ​                       | **Variable** ​ | **Assessment** ​ | **Age** ​ | | **Label English** ​                                                                                                                                                              | **Code** ​                       | **Variable** ​ | **Assessment** ​ | **Age** ​ |
-| Test Code                                                                                                                                                                                                       ​TCODE         | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| Session passed completion criteria? ​                                                                             | cogstate_completion_all_m_2 ​      | SessionCompletionPass ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Total presentations or trials. ​                                                                                                                                                 cogstate_presentations_all_m_1 ​ | PRESNT ​       | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| Test performance criteria ​                                                                                                                         ​cogstate_completion_all_m_2_XX ​      | TestCompletionPass ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Total correct responses ​                                                                                                                                                        ​| ​cogstate_correct_all_m_1 ​       | COR           | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| Session passed performance criteria? ​                                                                                | cogstate_performance_all_m_2 ​      SessionPerformancePass ​        | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Total error responses (includes FPos, FNeg, anticipations and max outs). ​                                                                                                       | cogstate_errors_all_m_1 ​        | ERR           | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| Test performance criteria ​                                                                                                                         | cogstate_performance_all_m_2_XX ​      | TestPerformancePass ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Speed measure - mean of the log10 transformed reaction time for correct responses ​                                                                                              ​| ​cogstate_speedtransf_all_m_1 ​   | LMNTRANS ​     | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| Session passed integrity criteria? ​                                                                                | cogstate_integrity_all_m_2 ​      | SessionIntegrityPass ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Speed measure - mean of reaction time for correct responses ​                                                                                                                    ​| ​cogstate_speed_all_m_1 ​         | LMNUNTRANS ​   | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| Test integrity criteria <sup> i </​sup> ​                                                                                | cogstate_integrity_all_m_2_XX ​      | TestIntegrityPass ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Speed measure - standard deviation of the log10 transformed reaction time for correct responses ​                                                                                ​| ​cogstate_logstdev_all_m_1 ​      | LSD           | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| The total duration of the current session (ms)                                                                                 | cogstate_durationtotal_all_m_2 ​      | SessionDuration ​         | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Accuracy measure - arcsine square root transformed - hitrate (correct responses divided by total responses (total includes TPos, TNeg, FPos, FNeg, anticipations and max outs)  cogstate_hitratetransf_all_m_1 ​ | ACCTRANS ​     | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| The total time (ms) from test start until the end of the test                                                                                 | cogstate_duration_all_m_2_XX ​      | TestDuration ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| Accuracy measure - hit rate (correct responses divided by total responses (total includes TPos, TNeg, FPos, FNeg, anticipations and max outs)                                   ​cogstate_hitrate_all_m_1 ​       | ACCUNTRANS ​   | [[2A Visit 1]]  | 13+      | +| The score on the primary outcome for this test <sup> ii </​sup> ​                                                                                | cogstate_primaryoutcome_all_m_2_XX ​      | PrimaryOutcome ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
-| CPAL and ISLT specific - "​Stimuli"​. For CPAL is total filled markers, and for ISLT is total words in the presented list.                                                        cogstate_stimuli_all_m_1 ​       | STI           | [[2A Visit 1]]  | 13+      |+| The score on the alternate outcome for this test <sup> iii </​sup> ​                                                                                | cogstate_outcomealt_all_m_2_XX ​      | AlternateOutcome ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Raw reaction time of performance (ms)                                                                                 | cogstate_speed_all_m_2_XX ​      | RawReactionTime ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Reaction time of performance (log10 ms)                                                                                  | cogstate_speedtransf_all_m_2_XX ​      | ReactionTime ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Raw consistency of performance (ms)                                                                                 | cogstate_consistency_m_2_XX ​      | RawRTVariability ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Consistency of performance (log10 ms)                                                                                 | cogstate_consistencytransf_m_2_XX ​      | RTVariability ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Raw accuracy of performance ​                                                                                                                        | cogstate_accuracy_all_m_2_XX ​      | RawAccuracy ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Accuracy of performance (arcsine square root proportion correct) ​                                                                                | cogstate_accuracytransf_all_m_2_XX ​      | Accuracy ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of correct responses / test XX | cogstate_correct_all_m_2_XX ​      | TotalCorrect ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of correct responses after pant responses have been excluded ​                                                                                | cogstate_correctexclpant_all_m_2_XX ​      | TotalCorrectExclPant ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of errors ​                                                                                                                        | cogstate_errors_all_m_2_XX ​      | TotalErrors ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+   | 
 +| Number of legal errors ​                                                                                                                        | cogstate_legalerrors_all_m_2_XX ​      | LegalErrors ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of errors that break the rules of the test                                                                                 | cogstate_rulebreak_all_m_2_XX ​      | RuleBreakErrors ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of anticipatory responses ​                                                                                | cogstate_anticipatory_all_m_2_XX ​      | TotalAnticipatory ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of post responses ​                                                                                                                        | cogstate_postresponses_all_m_2_XX ​      | TotalPost ​         | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of maxout responses <sup> iv </​sup> ​                                                                                | cogstate_maxout_all_m_2_XX ​      | TotalMaxOut ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| number of responses (correct + errors) ​                                                                                | cogstate_responses_all_m_2_XX ​      | TotalResponses ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Number of stimuli ​                                                                                                                        | cogstate_stimuli_all_m_2_XX ​      | TotalTrials ​        | [[3A Visit 1]]  | 13+   | 
 +| Standardized z-score for the primary outcome measure ​                                                                                | cogstate_zscore_all_m_2_XX ​      | StandardScoreZ ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Standardized t-score for the primary outcome measure ​                                                                                | cogstate_tscore_all_m_2_XX ​      | StandardScoreT ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| standardized z-score for the alternate outcome measure <sup> iii </​sup> ​                                                                                | cogstate_zscorealt_all_m_2_XX ​      | AltstandardScoreZ ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Standardized t-score for the alternate outcome measure <sup> iii </​sup> ​                                                                                | cogstate_tscorealt_all_m_2_XX ​      | AltstandardScoreT ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| The score on the psychomotor function/​attention composite, incorporating the primary outcome measure for the detection and identification tests, relative to age-matched normative data                                         | cogstate_psyattscore_all_m_2_XX ​      | PsyAttStdScr ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| The score on the learning/​working memory composite, incorporating the primary outcome measures for the one card learning and one back tests (accuracy), relative to age-matched normative data                                         | cogstate_learnwmscore_all_m_2_XX ​      | LearnWMStdScr ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| The score on the learning/​working memory composite, incorporating the primary outcome measure for the ocl test (accuracy) and the alternate outcome measure for the onb test (reaction time), relative to age-matched normative data                                                                                                                         | cogstate_scorealt_all_m_2_XX ​      | AltLearnWMStdScr ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Left- or righthanded ​                                                                                                       | cogstate_handedness_all_q_1 ​      | Hand           | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Test completion criteria ​                                                                                                                  | cogstate_completion_all_m_1_XX ​      | Completion ​         | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Test integrity criteria ​                                                                                            | cogstate_integrity_all_m_1_XX ​      | Integrity ​          | [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Total presentations or trials. ​                                                                                                                                             cogstate_presentations_all_m_1_XX ​ | PRESNT ​       | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Total correct responses ​                                                                                                                                                        ​| ​cogstate_correct_all_m_1_XX ​       | COR           | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Total error responses (includes FPos, FNeg, anticipations and max outs). ​                                                                                                       | cogstate_errors_all_m_1_XX ​        | ERR           | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Speed measure - mean of the log10 transformed reaction time for correct responses ​                                                                                              ​| ​cogstate_speedtransf_all_m_1_XX ​   | LMNTRANS ​     | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Speed measure - mean of reaction time for correct responses ​                                                                                                                    ​| ​cogstate_speed_all_m_1_XX ​         | LMNUNTRANS ​   | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Speed measure - standard deviation of the log10 transformed reaction time for correct responses ​                                                                                ​| ​cogstate_logstdev_all_m_1_XX ​      | LSD           | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Accuracy measure - arcsine square root transformed - hitrate (correct responses divided by total responses (total includes TPos, TNeg, FPos, FNeg, anticipations and max outs)                                                       ​cogstate_hitratetransf_all_m_1_XX ​ | ACCTRANS ​     | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| Accuracy measure - hit rate (correct responses divided by total responses (total includes TPos, TNeg, FPos, FNeg, anticipations and max outs)                                                                                        cogstate_hitrate_all_m_1_XX ​       | ACCUNTRANS ​   | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +| CPAL and ISLT specific - "​Stimuli"​. For CPAL is total filled markers, and for ISLT is total words in the presented list.                                                                                                                                cogstate_stimuli_all_m_1_XX ​       | STI           | [[2A Visit 1]] \\ [[3A Visit 1]]  | 13+      | 
 +<sup> i </​sup>​ Only calculated on test _02 (Identification task) \\ 
 +<sup> ii </​sup>​ Primary outcome is reaction time (Detection/​Identification task) or accuracy (One Back/One Card Learning task) \\ 
 +<sup> iii </​sup>​ Only calculated on test _04 (One Back task) \\ 
 +<sup> iv </​sup>​ Calculated on tests _01,_02 and _04 (Detection, One back and One Card Learning task) 
 +\\ 
  
cogstate.txt · Last modified: 2023/09/26 15:20 by flip